Amber
使用Amber计算单点能三步走
本文主要介绍了如何使用Amber来计算一个给定分子构象的pdb文件的单点势能值。基本流程可以分为三个步骤:首先从力场文件中去寻找对应于输入构象的力场参数,然后配置一个执行参数文件,最后使用这些保存下来的文件来计算分子单点能。 ......
Ubuntu22.04安装AMBER22-串行+Cuda+并行版
本人新采购了一台DELL工作站,准备作为计算平台。最近又听说AMBER22学术免费了,于是尝试在工作站上安装。 安装过程主要参考的是Amber22的手册, * 安装环境:Ubuntu 22.04.3 LTS,RTX 4090,【gcc,g++,gfortran】10.5.0,CUDA 11.2,cm ......