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由基因型-组织表达项目（GTEx）联想开去
近日，由丹麦奥胡斯大学、华南农业大学、中国农科院基因组所、美国农业部、马里兰大学、爱丁堡大学和等多家单位联合发起的猪基因型-组织表达计划（PigGTEx）取得阶段性进展，成功构建猪基因型-组织表达图谱，相关文章 “A compendium of genetic regulatory effects ......
2024.1.9
几天看了一点off-by-one的实例部分，没看多少 然后看了一点网络安全的相关知识，感觉不能一直盯着个pwn学，网络安全整体的也要学一下，正好之后二学历课程也有网络安全，就当提前预习一下 隔了一个多月没学网络安全，感觉那种学习的状态要完全找回来也不是那么容易，总之先慢慢来，每天看一点也好过什么都不 ......
kettle从入门到精通 第二十九课 job 循环 检验字段的值
1、平常我们在用kettle设计job的时候，会用到循环来处理一些业务逻辑，比如循环检测某个表中的数据条数等。这个时候就会用到一个特别重要的步骤：检验字段的值。 下图是一个的通过初始化DNOE变量为false，等待3s之后更新DONE变量为true的一个循环demo。 2、设置变量步骤，可以从属性文 ......
什么是中间件？
什么是中间件？ 大家号，我是銘，全栈开发程序员。 今天我们来聊以来什么是中间件？在Java中，中间件是一种基于 Java 技术的中间件，常见的Java中间件有 Web中间件、消息中间件、分 布式缓存中间件 、分布式事务中间件 、数据库中间件、RPC 中间件 。 1、Web 中间件是一种基于 Java ......
Omics辅助育种统计方法：GBLUP和rrBLUP
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节：genomic BLUP and ridge regression BLUP。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提 ......
Omics辅助育种统计方法：最小二乘与混合模型
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节：Applications for Ordinary Least Squares and Mixed Models。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规 ......
Omics辅助育种统计方法：基因组遗传力
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节： Genomic heritability。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度 ......
GS | Ben Hayes报告：基因型数据基础
本报告是Ben Hayes和Hans Daetwyler合著。 关于Ben Hayes，前文已经介绍。详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基 ......
GS | 佛罗里达大学Salvador报告：数量遗传和育种中的混合模型
本报告来自佛罗里达大学Salvador A. Gezanboshi博士。Salvador是一位拥有20多年经验的育种家/数量遗传学家，在育种、统计分析和遗传改良咨询方面有着丰富的经验。同时，他也是VSN的国际顾问，没错，就是那个开发了大名鼎鼎的ASReml的VSN。在大学或研究机构任职期间，他主要集 ......
关于2023分子植物育种大会随笔记录与思考
目录智能育种转基因基因编辑育种实践 2023年底分子植物育种大会在成都举行，会后要点胡乱记录之。有些来自嘉宾观点，有些是个人思考，杂糅一起，仅供参考。 智能育种 分子设计育种：形态、生理、基因、等位基因、单倍型、基因组区段、通路、网络、表观组。统言之，生物相关分子皆可设计。 科迪华玉米GP预测（Al ......
2023广东种业大会大咖观点记录与总结
目录刘耀光院士（华南农业大学）傅廷栋院士（华中农业大学）罗锡文院士（华南农业大学）彭其明（海泽拉启明种业）张传清（大北农创种科技）何艺兵（农业农村部科学技术司）杨雅生（深圳市种子同业商会、闯创世纪种业）李君明（中国农业科学院蔬菜花卉研究所）吕玉平（隆平生物）王冰冰（百奥云）刘铁斌（绿亨科技）张浩（鲜 ......
基于无人机高通量植物表型大数据分析及应用研究综述
目录数据采集无人机系统数据预处理图像拼接颜色转换和校正图像分割数据分析图像分析关键技术作物株高提取叶面积指数提取技术植物病害检测技术 基于无人机系统的作物表型分析方法集数据采集、处理和分析于一身，大大缩短和精简了作物表型研究的时间和过程。首先，利用小型无人机在作物种植区域进行图像数据的采集；获取完毕 ......
生物农学就业投票结果出炉
前段时间发牢骚写了一篇推文：论农业院校对于农学人才培养的缺失，引发了大家对于生物和农学方向就业问题的一些讨论（虽然推文并不是说这个问题）。随后，为了解大家具体的就业情况，小编随便设计了几个简单的问题来进行投票：关于生物农学方向就业情况的调查。截止目前，共有179人参与投票。让我们一起来看看结果吧。 ......
2023年终总结，但是废话版.....
大家好，这里是生物信息与育种。 值此年末之际，一年的尾巴也就到来了。在这里我要对过去的一年做出总结，来总结我这一年所做的事。 这一年过得非常忙碌，但在忙碌的同时也很颓废，在颓废的同时又很焦虑。 这一年有开心也有难过，有收获也有失去。 当然相信每个人也都是如此。 在工作中，我一直在自己的岗位上勤勤恳恳 ......
推荐 | 现代生物学的现代统计学
上世纪30年代，受Fisher关于显著性和假设检验的影响，统计数据分析流程一般如下图所示。 70年代，Tukey推荐使用探索性数据分析（EDA）进行统计分析。EDA 建立在数据可视化的基础上，然后辅以验证性数据分析 （CDA）：假设驱动的推理方法，理想情况下应该是稳健的，而不是依赖于复杂的假设。 9 ......
JAVA（集合）
集合 集合和已经学过的数组比较类似，本身也是一种引用类型，而且可以保存很多个数据 区别于数组长度不可以改变，集合长度可以任意改变。 集合包含很多种，ArrayList,HashSet,linkedList,HashMap. ArrayList 导包 import java.util.ArrayLis ......
代码随想录 day13 滑动窗口最大值 前 K 个高频元素
滑动窗口最大值 这题第一次见 比较难找到思路 滑动窗口的移动比较类似于队列的行为 但是我们需要找到其中的最大值 在线性时间复杂度下 只能维护这个队列保持单调性 但是我们没有这样的一个可以在移动中保持单调的数据结构 只能自己手动创建 我们利用deque进行队列的创建 这个队列有三个基本函数 pop 用 ......
GS | Julius报告：基因组预测的准确性
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
GS | Julius报告：利用基因组信息预测遗传变化
Julius Van der Werf是新英格兰大学（University of New England，UNE）教授，专门从事遗传评估、育种计划设计、育种目标和基因组选择方面的研究。他指导了60多名博士生。2003 年至 2019 年，他担任绵羊 CRC 遗传学项目的经理，在此期间，澳大利亚绵羊产 ......
GS | Ben Hayes的基因组选择课程
关于Ben Hayes详见：https://qaafi.uq.edu.au/profile/1059/ben-hayes Ben Hayes是澳大利亚昆士兰大学教授，昆士兰州农业和食品创新联盟动物科学中心主任，也是千牛基因组计划的发起者。在牲畜、作物、牧场和水产养殖物种的遗传改良方面拥有丰富的研究经 ......
Omics辅助育种统计方法：Bayes网络
此幻灯片是来自“Omics辅助育种统计方法”短期课程中的一节：Bayesian Networks。作者Malachy Campbell，博后毕业于康奈尔大学，是一名计算生物学家，专注于统计基因组学和数量遗传学。热衷于从大规模、复杂且常常带有噪音的多维数据中提取生物学意义。研究目标是利用高维度的表型数 ......
【学习笔记】树状数组
树状数组支持两种操作： 单点修改 区间求和 如果我们使用普通数组，这两种操作的时间复杂度分别为 \(O(1)\) 和 \(O(n)\)。虽然修改的时间复杂度很低，但是求和操作在数据量很大的情况下就会很耗时。如果我们使用前缀和，那么区间求和的时间复杂度就会降为 \(O(1)\)，而单点修改会影响到后面 ......
FEB
题目描述 有一个长度为 N的字符串 S，其中的每个字符要么是 B，要么是 E。 我们规定 S的价值等于其中包含的子串 BB 以及子串 EE 的数量之和。 例如，BBBEEE 中包含 2个 BB 以及 2个 EE，所以 BBBEEE 的价值等于 4。 我们想要计算 S的价值，不幸的是，在我们得到 S之 ......
C# 成为2023年度编程语言之王
原文发表在公众号 腾讯云开发者：https://mp.weixin.qq.com/s/5owE5hmJVkwOLJrKMXfR6Q导读2023 TIOBE 年度编程语言正式揭晓，C# 在陪跑多年后首次斩获这一殊荣。TIOBE表示，C#在 Web 应用后端和游戏等领域变得持续流行，并开始蚕食 Java ......
碰撞的小球（Colliding balls）
效果如下： 代码: #include <bits/stdc++.h> #include <graphics.h>//必须库 #include <time.h> using namespace std; int main() { initgraph(650,400);//背景图大小 circle(10 ......
04django
作业讲解 1.数据展示 2.给按钮附加功能 3.如何明确用户到底想要编辑那条数据 在路由匹配中就应该获取到用户想要编辑的数据主键值 4.点击编辑按纽 应该展示当前数据的编辑页面 通过无名或有名分组获取到用户想要编辑的数据主键值 获取对应的数据对象传递给页面 展示给用户看并提供编辑功能 5.编写删除功 ......
贪心国王游戏
贪心 耍杂技的牛 国王游戏同款思路 大部分贪心用的都是已经被证明过的知名的数学模型 贪心得到的答案 >= 最优解 贪心得到答案 <= 最优解 #include<iostream> #include<algorithm> using namespace std; // 给 pair<int, int> ......
关于前端的vue3框架遇到的一些问题.前后端分页和js,ts进行编写时的区别
分页有两种形式,一种是前端进行分页,一种是后端进行分页 前端分页: 1. 在普通js写法中,需要有默认函数,在函数内进行编写功能实现比如以下代码: export default { data() { return { tableData: [], page: 1, limit: 10, total: ......
CodeForces 1919F2 Wine Factory (Hard Version)
洛谷传送门 CF 传送门 题目看着感觉很像最大流，不妨建模，\(S \to i\)，容量为 \(a_i\)；\(i \to T\)，容量为 \(b_i\)；\(i \to i + 1\)，容量为 \(c_i\)。答案是这个图的最大流。 考虑最大流转最小割。观察到 \(S \to i\) 和 \(i ......
Go语言接口防并发常用方案
Go语言接口防并发常用方案 原创 枫潇潇兮 程序员技术成长之路 2024-01-09 08:30 发表于福建 听全文 Go语言中处理并发的常见策略涉及了并发原语，如互斥锁（sync.Mutex）、读写锁（sync.RWMutex）、通道（channel）以及原子操作（sync/atomic）。接口（ ......