建库过程PCA扩增过程中引入重复序列，会对变异检测结果产生影响，重复的DNA片段会比对到参考基因组的相同位置，根据这一特点来进行去重复。
001、gatk（picard标记重复）
gatk MarkDuplicates -I sample01.sorted.bam -O sample01.sorted.markdup.bam -M sample01.sorted.markdup_metrics.txt
002、samtools
.
bam文件去重复
发布时间 2023-09-22 23:05:06作者: 小鲨鱼2018