001、 借助数组实现
[root@pc1 test]# ls a.fa [root@pc1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattccgg ttcc >chr2 ttccc >chr3 tttc cct ## 统计脚本 [root@pc1 test]# awk '{if($0 ~ /^>/) {tmp=$0; ay[tmp] = 0} else {ay[tmp] += length($0)}}END {for (i in ay) print i, ay[i]}' a.fa >chr3 7 >chr1 12 >chr2 5
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