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linux 中 trimmomatic软件的安装及使用

发布时间 2023-09-19 22:30:16作者: 小鲨鱼2018

 

001、下载

官网：http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic

 

下载0.39版本：

 

002、上传至linux 中，然后解压

[root@pc1 software]# ls              ## 列出安装包
Trimmomatic-0.39.zip
[root@pc1 software]# unzip Trimmomatic-0.39.zip         ## 解压
Archive:  Trimmomatic-0.39.zip
   creating: Trimmomatic-0.39/
  inflating: Trimmomatic-0.39/LICENSE
  inflating: Trimmomatic-0.39/trimmomatic-0.39.jar
   creating: Trimmomatic-0.39/adapters/
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/NexteraPE-PE.fa
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/TruSeq2-PE.fa
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/TruSeq2-SE.fa
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/TruSeq3-PE-2.fa
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/TruSeq3-PE.fa
  inflating: Trimmomatic-0.39/adapters/TruSeq3-SE.fa
[root@pc1 software]# cd Trimmomatic-0.39/         ## 进入解压目录
[root@pc1 Trimmomatic-0.39]# ls                   ## 可执行java程序
adapters  LICENSE  trimmomatic-0.39.jar